Ученые успешно использовали "секвенирование следующего поколения" для выявления мутаций, которые могут вызвать редкое и загадочное генетическое заболевание. Исследование, опубликованное Cell Press 29 июля в Американском журнале генетики человека, демонстрирует, что секвенирование всего пораженного человека "экзом"; то есть все гены, несущие инструкции по производству белков, могут выявить критические гены, которые при мутанте вызывают наследственные нарушения.
Синдром Перро – это рецессивное заболевание, которое связано с потерей слуха у мальчиков и девочек и нарушением функции яичников у девочек. У некоторых людей с синдромом Перро также есть неврологические симптомы. До настоящего исследования гены синдрома Перро не были идентифицированы.
Исследовательская группа под руководством Мэри-Клэр Кинг, доктора философии из Вашингтонского университета в Сиэтле, изучала генетику синдрома Перро в небольшой семье, изначально имеющей ирландско-итальянское происхождение, в которую входили две сестры с хорошо выраженным синдромом Перро.
"Поскольку семья небольшая и не имеет кровного родства (оба родителя произошли от общего предка), стандартные методы генетического картирования не были бы информативными для определения ответственного гена," объясняет доктор. король. "Вместо этого мы попытались идентифицировать ген, ответственный за синдром Перро в этом семействе, с помощью секвенирования всего экзома." Экзом можно рассматривать как своего рода генетический план синтеза белков.
После секвенирования всего экзома одной из сестер исследователи идентифицировали единственный ген (HSD17B4), который демонстрировал два редких функциональных варианта. Этот ген кодирует D-бифункциональный белок (DBP), многофункциональный фермент, участвующий в метаболизме липидов. Подчеркнув генетическое разнообразие болезни, исследователи продолжили показывать, что шесть других семей с синдромом Перро имели нормальный HSD17B4.
"Известно, что другие мутации в HSD17B4 вызывают очень тяжелый врожденный синдром, называемый дефицитом ДАД, который обычно приводит к летальному исходу в течение первых двух лет жизни," говорит доктор. король. "Не сообщалось, что девочки с дефицитом ДАД пережили период полового созревания, поэтому ранее не было известно, что аномалии яичников связаны с этим заболеванием. Несколько человек, о которых сообщалось, долгое время пережившие дефицит ДАД, демонстрируют потерю слуха и неврологическую дисфункцию."
Взятые вместе, результаты показывают, что синдром Перро и дефицит ДАД имеют некоторые общие клинические симптомы, и что очень легкие случаи дефицита ДАД могут быть недооценены. "Наше исследование также демонстрирует, что секвенирование всего экзома может выявить критические гены в небольших некровных семьях," заключает доктор. король.