Фаги – вирусы, поражающие бактерии, – в изобилии присутствуют в бактериях, населяющих женский мочевой пузырь. Это хорошая новость, потому что фаг можно использовать в качестве альтернативного лечения, когда антибиотики становятся устойчивыми к патогенным бактериям. Об исследовании сообщается на этой неделе в Журнале бактериологии, публикации Американского общества микробиологов.
"Фаги использовались в качестве альтернативы антибиотикам на протяжении десятилетий в странах Восточной Европы, особенно для лечения инфекций мочевыводящих путей," сказала автор-корреспондент Кэтрин Путонти, доктор философии, доцент кафедры биоинформатики, Университет Лойола, Чикаго. "Этот первый шаг в характеристике фагов, уже присутствующих в мочевом пузыре, потенциально может выявить кандидатов для последующих клинических исследований фаговой терапии для лечения симптомов мочевого пузыря."
Исследователи изучили 181 бактериальный геном, взятый из микробиома женской мочи. Путонти сказал, что они представляют филогенетическое разнообразие этого микробиома.
"Мы обнаружили, что лизогенные фаги [фаги, которые вставляют свою ДНК в геномы своих хозяев] широко распространены в бактериях мочевого пузыря," сказал доктор. Путонти. "На самом деле их больше, чем мы ожидали," она сказала.
Исследователи обнаружили в микробиоме мочи 457 в основном новых фаговых последовательностей. "Хотя в настоящее время проводятся многочисленные исследования фагов в кишечнике, ротовой полости, влагалище, коже и т. Д., это первый крупномасштабный взгляд на фаги в мочевом пузыре," сказал доктор. Путонти.
Однако вирусные последовательности, обнаруженные в геномах, часто являются окаменелостями давних инфекций, которые больше не могут воспроизводить независимые вирусные частицы, которые затем могут инфицировать дополнительные бактерии. Чтобы проверить жизнеспособность этих последовательностей, исследователи выбрали один из 181 бактериального генома и обнаружили, что они способны индуцировать одну из нескольких фаговых последовательностей в этом геноме для воспроизведения.
Исследователи также обнаружили, что фаги от разных женщин явно связаны между собой. "Это говорит о том, что, как и в кишечнике, может существовать общий набор фагов, находящихся в мочевом пузыре или, по крайней мере, в женском мочевом пузыре," сказал доктор. Путонти.
Наблюдались некоторые различия в количестве фагов из здорового мочевого пузыря по сравнению с. изолированные от женщин с симптомами инфекций мочевыводящих путей. "Это говорит о том, что фаг может способствовать здоровью мочевыводящих путей и является новым захватывающим направлением для будущих исследований," сказал доктор. Путонти.
"Это только первое из многочисленных исследований фагового разнообразия микробиома мочи," сказал доктор. Путонти.
До недавнего времени считалось, что моча здоровых людей стерильна. Соавтор Алан Вулф, доктор философии, профессор микробиологии и иммунологии в Лойоле, опроверг эту догму, когда его лаборатория обнаружила женский мочевой микробиом, и он был в авангарде выделения и характеристики отдельных видов бактерий из этого нового бактериального сообщества.