Медицина точности – появляющаяся область, которая стремится поставлять высоко персонализированное здравоохранение, понимая, как индивидуальные различия в генетике, окружающей среде и образе жизни влияют на здоровье и болезнь.SLE, обычно называемая волчанка, является серьезной, потенциально смертельной аутоиммунной болезнью, что влияние отчетов Национальных Институтов Здоровья в девять раз больше женщин, чем мужчины, и, более вероятно, ударит молодого афроамериканца, латиноамериканца, азиата и индейских женщин.
Болезнь часто начинается между возрастами 15 и 44.«SLE начинается, когда иммунная система нападает на многократные системы органа в теле, которое может привести к сложному множеству признаков, которыми трудно управлять клинически и могут привести к повреждению органа», сказал доктор Эдвард Уокелэнд, Председатель Иммунологии в UT Юго-западный и co-ведущий-автор исследования, размещенного в Интернете недавно в iLife журнала. «Наши результаты поддерживают потенциал медицины точности, чтобы предоставить клинически релевантную информацию о генетической восприимчивости, которая может в конечном счете улучшить диагноз и лечение».Исследование также может иметь последствия для других системных аутоиммунных болезней, категории болезней, которые затрагивают многократные системы тела и включают диабет 1 типа, ревматоидный артрит и рассеянный склероз, сказал он.Доктор Уокелэнд и коллеги упорядочили миллионы пар оснований ДНК больше чем от 1 700 человек, которые позволили точную идентификацию наследственной изменчивости, способствующей SLE, сказал он.
Определенно, исследователи определили 1 206 изменений ДНК, расположенных в 16 различных областях генома человека, связанного с увеличенной восприимчивостью к SLE. Они тогда показали, что почти все они (1,199) изменяют уровень выражения определенных молекул, которые регулируют иммунные реакции, сказал он.Кроме того, двухлетнее исследование определило многие определенные регулирующие изменения, которые были изменены в пациентах SLE и продемонстрировали, что точно идентификация таких так называемых причинных вариантов увеличила точность генетической ассоциации отдельных генов риска SLE с восприимчивостью к SLE.«До нашего исследования не был сделан такой всесторонний анализ последовательности, и мало было известно о точной наследственной изменчивости, которая изменяет функции генов та причина SLE», добавил доктор Уокелэнд, который считает Эдвина Л. Кокса Выдающимся Стулом в Иммунологии и Генетике.
Ученые начали свой всесторонний анализ последовательности, используя образцы ДНК 1 349 американских европейцев (773 с болезнью SLE и 576 без) из типовых коллекций в Юго-западном UT, Университет Южной Калифорнии, Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе, Оклахома Медицинский Исследовательский фонд и Лувенский католический университет в Бельгии.Они тогда определили точные последовательности ДНК в SLE-связанных генетических регионах, рассеянных всюду по геному. Они нашли, что риск SLE связан с определенными группами изменений ДНК, обычно называемого haplotypes, и что некоторый haplotypes увеличил риск для SLE, в то время как другие обеспечили защиту от SLE.
После идентификации наборов вариантов ДНК, которые увеличили восприимчивость SLE в белых, они использовали многократные общественные базы данных, включая международные 1 000 Проектов Геномов (2 504 геномных образца от глобального народонаселения), чтобы определить, были ли эти haplotypes также найдены в южноамериканце, выходце из Южной Азии, африканце и восточноазиатском населении.Они обнаружили, что варианты и haplotypes были распределены через поднаселение во всем мире. Их результаты указывают, что много общих haplotypes в иммунной системе разделены на различных частотах всюду по мировому населению, предложив, чтобы эти изменения в иммунной системе возникли и сохранились в населении в течение многих длительных периодов, сказал доктор Уокелэнд.
«Мы благодарим многих пациентов SLE и управляем участниками, типовые вклады которых были важны для этих исследований», написали исследователи.Доктор Уокелэнд и коллеги планируют продолжить исследование, получая больше образцов ДНК и расширяя их анализ до дополнительных генов риска SLE с целью получения набора данных, который может использоваться, чтобы предсказать уникальный риск человека SLE, а также вероятность пользы от определенного лечения.«Выполнимо, что этот тот же самый тип генетического анализа позволит объединение в кластеры пациентов SLE в определенные группы, на основе их генетической предрасположенности, которая улучшила бы лечение и потенциально позволила бы развитие более целенаправленных методов лечения», сказал доктор Уокелэнд.
Ранее в этом месяце Юго-западное UT объявило, что доктор Уокелэнд, лаборатория которого долго служила Средством Ядра Геномики и Микромножества учреждения, будет вести большую упорядочивающую ДНК инициативу обратиться к важным клиническим проблемам. Новое клиническое упорядочивающее средство, в сотрудничестве с Отделом Патологии, предоставит группе, упорядочивающей для рака и других диагнозов, и в конечном счете расширится до целого-exome и анализа последовательности целого генома для множества пациентов. Лаборатория будет основана в BioCenter в Восточном Кампусе. Чтобы передать полное усилие этой инициативе, доктор Уокелэнд уйдет с должности Председателя Иммунологии, но останется в этой роли, пока его преемника не назовут.
«Это клиническое упорядочивающее основное средство произведет лабораторные данные, которые будут использоваться для оценки терпеливых опухолей. Я надеюсь, что мы когда-нибудь расширимся до пациентов генотипирования, чтобы определить потенциальную восприимчивость к аутоиммунной болезни и многим другим условиям, поскольку область медицины точности развивается», сказал доктор Уокелэнд.