Команда исследователей из нескольких кафедр Стэнфордского университета создала клеточный атлас легкого человека, в котором выделены десятки типов клеток, составляющих части легких. В своей статье, опубликованной в журнале Nature, исследователи описывают свою работу (в основном включающую секвенирование одноклеточной РНК) и некоторые вещи, которые они узнали о легких во время своих усилий.
Для создания атласа исследователи собрали образцы тканей бронхиол, бронхов и альвеолярных областей легких, а также соответствующие образцы крови. Каждый из образцов был разбит на клеточные компоненты, которые затем были отсортированы по типу: иммунный, эпителиальный, эндотелийный или стомальный.
Исследователи сгенерировали транскриптомы примерно для 75000 клеток. Используя маркеры, команда затем сгруппировала клетки, чтобы выявить 58 различных популяций клеток. При этом они смогли сгенерировать профили экспрессии для 91 процента типов легких, а также обнаружили 14 типов клеток легких, ранее не известных науке. Они также нашли около 200 маркеров, которые можно использовать для идентификации обнаруженных ими неизвестных типов.
Команда обнаружила, что они смогли использовать получившийся атлас для отслеживания целевых гормонов в легких. При этом они обнаружили, что некоторые рецепторы гормонов широко экспрессируются в разных частях легких, а другие – нет. И в рамках этих дополнительных усилий исследователи также определили области, в которых экспрессируются 233 гена, которые могут быть использованы учеными, работающими над пониманием и лечением широкого спектра заболеваний легких.
Исследователи также использовали свой атлас для сравнения легких человека и мыши. Они обнаружили, что у мышей отсутствует примерно 30% типов клеток легких человека, а у людей – примерно 5% типов клеток легких мыши. Они предполагают, что это открытие указывает на то, что, возможно, было больше разнообразия ранних видов млекопитающих, чем считалось ранее.
Исследователи предполагают, что атлас может быть использован широким кругом медицинских исследователей, отмечая, что он дает новое понимание регуляции, взаимодействия и функции легочных клеток и типов.