Как сообщают бельгийские исследователи, наиболее полный анализ эпигенетических модификаций, присутствующих при раке груди, выявил потенциально важные новые способы обнаружения и лечения этого заболевания.
Эпигенетика – это термин, используемый для описания модификаций молекулы ДНК, которые влияют на то, как ее код транслируется в белки. Эти изменения включают метилирование, форму химической модификации.
Хотя исследователи знали, что эпигенетика играет важную роль при раке, информация о ее точном вкладе в канцерогенез груди была скудной, объяснила д-р Сара Дедеурвардер из Университета Свободного де Брюсселя в Брюсселе на конференции IMPAKT по раку груди.
"Наша цель состояла в том, чтобы оценить эпигенетические различия между образцами нормальной ткани и первичной опухоли в масштабе всего генома, аналогично тому, что было сделано для паттернов экспрессии генов," Д-р Дедеурвардер сказал. "Здесь мы кратко рассмотрим, что профилирование ДНК метилирования первичных опухолей молочной железы может привести к нашему пониманию их биологии и разнообразия? что должно способствовать лучшему ведению пациентов с раком груди."
Исследователи выполнили комплексный профиль метилирования ДНК на двух независимых наборах замороженных образцов ткани груди: «основной набор» из 123 образцов и «набор для проверки» из 125 образцов.
Их первым открытием были два основных подтипа рака груди, определенных в зависимости от того, экспрессирует ли рак рецепторы эстрогена, которые широко контролируются эпигенетически. "Когда мы выполнили кластерный анализ наших образцов на основе их профилей метилирования ДНК, опухоли естественным образом разделились на две отдельные группы," Д-р Дедеурвардер сказал.
Первая группа состояла в основном из опухолей, отрицательных по рецепторам эстрогена, а вторая – из опухолей, положительных по рецепторам эстрогена. "Это указывает на то, что ER-отрицательные и ER-положительные опухоли имеют очень разные профили метилирования," она сказала.
"Более того, когда мы рассмотрели более 400 генов, экспрессия которых положительно или отрицательно коррелирует с экспрессией гена ER, мы показали обратную корреляцию между метилированием и статусом экспрессии большинства этих генов. Это предполагает, что эпигенетика, вероятно, участвует в регуляции экспрессии генов, играющих важную роль в установлении двух основных фенотипов рака молочной железы, определяемых статусом ER."
Анализ также выявил новую информацию о новых подтипах рака груди. Исследователи показали, что профили метилирования ДНК позволяют классифицировать опухоли молочной железы в большее количество групп, чем те, которые определены в настоящее время.
"Это действительно самая интересная часть этих данных," Д-р Дедеурвардер сказал. "Действительно, несколько пациентов с одним и тем же известным подтипом рака груди могут по-разному реагировать на то или иное лекарство. Эпигенетическая разница между опухолями этих пациентов может объяснить наблюдаемую разницу с точки зрения ответа на лечение. Следовательно, профилирование метилирования ДНК может помочь уточнить текущую классификацию рака молочной железы и, таким образом, может помочь разделить пациентов в рамках определенного подтипа как с точки зрения прогноза, так и с точки зрения прогноза ответа на лечение."
"Я думаю, что мы можем использовать эпигенетическую информацию для улучшения лечения рака несколькими способами," Д-р Дедеурвардер сказал. "Во-первых, несколько линий доказательств предполагают, что эпигенетическая дисрегуляция возникает на ранней стадии канцерогенеза и может быть обнаружена в жидкостях организма. Таким образом, маркеры метилирования ДНК могут помочь в более раннем выявлении заболевания."
"Во-вторых, уже было показано, что маркеры метилирования ДНК могут помочь лучше стратифицировать пациентов с точки зрения прогноза. В-третьих, такие маркеры также могут помочь предсказать ответ на данный препарат."
"Наконец, возможна эпигенетическая терапия рака, отдельно или в сочетании с традиционными методами лечения," Д-р Дедеурвардер сказал. "Действительно, было разработано несколько лекарств, и несколько клинических испытаний уже показали многообещающие результаты, в частности, при лейкемии."
"В этом исследовании мы создали самый большой и наиболее полный набор данных о метилировании ДНК для тканей опухоли груди человека," исследователи заключают. "Создавая основу для лучшего понимания гетерогенности рака груди и улучшенной таксономии опухолей, точные эпигенетические портреты, нарисованные в нашей работе, должны способствовать лучшему лечению пациентов с раком груди."
Комментируя исследование, в котором он не участвовал, профессор Фортунато Чиардиелло из Seconda Università di Napoli, Неаполь, Италия, отметил, что профили экспрессии генов с помощью анализа микроРНК позволили идентифицировать подгруппы рака груди человека с различным биологическим поведением и, в конечном итоге, другой прогноз.
"Теперь, впервые, эпигенетический анализ всего генома выявляет в большом количестве случаев рака груди человека ряд подтипов, которые могут помочь лучше определить более однородные группы, которые могут быть полезны для выбора подходящих и более персонализированных терапевтических подходов."