Исследователи количественно оценивают риск рака груди на основе редких вариантов и фонового риска

Редкие варианты в сочетании с фоновыми генетическими факторами риска могут быть причиной многих необъяснимых случаев семейного рака молочной железы, а знание конкретных вовлеченных генов может способствовать выбору стратегий профилактики и лечения, согласно результатам, представленным на пленарном заседании Американского общества генетики человека ( ASHG) Ежегодное собрание 2017 г. в Орландо, штат Флорида.

Исследователи На Ли, доктор медицины, представившие работу; Ян Кэмпбелл, доктор философии, ведущий исследователь; и их коллеги из Онкологического центра Питера МакКаллума в Мельбурне, Австралия, сосредоточили свое исследование на пациентах с высоким риском рака груди: пациентах с личным или семейным анамнезом, которые искали объяснения.

"Когда вы знаете, какой ген создает риск рака груди, вы можете дать более точную оценку риска, знать, чего ожидать и на что обращать внимание, а также адаптировать стратегии управления рисками к пациенту," сказал доктор. Кэмпбелл. К сожалению, примерно у половины этих пациентов из группы высокого риска не было обнаружено никакой известной генетической причины, что предполагает более сложное объяснение. В таких случаях генетики рака давно подозревали, что присутствует полигенный риск (риск, связанный с комбинацией генетических вариантов).

«Гены работают не сами по себе, а скорее как часть общего генетического контекста», – пояснил доктор. Ли. "Этот фон “полигенного риска” похож на пейзаж, полный холмов и долин, где каждый рискованный вариант похож на дом на его вершине," она сказала. "Если вы унаследуете вариант с высоким риском – высокий дом – но живете в долине, ваш общий риск рака груди может оказаться средним, потому что ваш генетический ландшафт снижает его."

Концепция фонового генетического риска не нова, но в течение многих лет у ученых не было инструментов для сбора и анализа тысяч геномов, необходимых для его количественной оценки. Недавние улучшения в технологии секвенирования следующего поколения решили эту проблему. В результате доктор. Ли и его коллеги смогли секвенировать до 1400 генов-кандидатов на рак груди у 6000 пациентов с семейным раком груди и 6000 контрольных групп без рака. В этой большой выборке они искали потенциально связанные с раком гены, предложенные литературой, сотрудниками и их собственными предыдущими результатами, и идентифицировали по крайней мере 46 генов, которые, по крайней мере, в два раза чаще имели мутации среди участников с раком груди, чем у тех, у кого был рак груди. без.

Они также использовали эти данные для расчета оценки полигенного риска для каждого пациента и объединили эту оценку с данными по их вариантам высокого и среднего риска, чтобы оценить общий риск развития рака груди у каждой пациентки. В ближайшие годы исследователи планируют расширить исследование на международном уровне для дальнейшего тестирования и уточнения своих результатов среди населения. Они также надеются принести эти более точные оценки риска в клинику, чтобы более точно убедить женщин в их личном риске рака или, если риск высок, посоветовать превентивные стратегии, такие как скрининг в более молодом возрасте.