Результаты были изданы 1 марта в американском Журнале Человеческой Генетики.GWAS определяют области генома, который может содержать сотни генов, потенциально затронутых мутацией. Отбор гена, чтобы учиться из этих обширных списков был очень спекулятивным. В лучшем случае ученые говорят, есть шанс 50-50, что ген, самый близкий к мутации, даже будет активен в типах клетки, затронутых болезнью.
«Мы находимся в сценарии, где мы можем собрать значительные суммы генетических данных, используя GWAS, но понимаем, что это не обеспечивает биологический контекст, в котором мы нуждаемся, чтобы понять результаты», говорит Энди Маккаллайон, доктор философии, помощник директора человеческой программы специализации генетики и адъюнкт-профессор молекулярной и сравнительной патобиологии в Медицинской школе Университета Джонса Хопкинса.Стратегия Маккаллайона понять все эти данные смотрит на активные гены в клетках, затронутых болезнью, группами генов, которые взаимодействуют друг с другом, их уязвимость для мутации и информации от прошлых научных исследований, чтобы отфильтровать больше чем тысячу генных кандидатов на риск заболевания вниз только к горстке в любом вовлеченном регионе.
Исследователи сосредоточились на болезни Паркинсона, которая влияет на нейроны допамина в мозгу. GWAS определяют 49 разделов генома, у которых есть мутация, относящаяся к болезни Паркинсона, говорит Маккаллайон. При помощи стратегии он и его команда смогли отфильтровать вниз тысячи генов в этих разделах в среднем к два за регион.
Исследователи тогда спросили, включают ли гены, которые они нашли, тех, которые, как ранее находят, вызвали болезнь Паркинсона. Из генов, вовлеченных в болезнь Паркинсона, которые присутствуют в обозначенных регионах, стратегия захватила все кроме одного. «Однако того, который мы не захватили, не выражают в допаминергических нейронах», объясняет Маккаллайон. «Это вселяет нам веру, что другие гены, на которые указывают, будут важны для болезни».Исследователи надеются изучить биологические контексты болезни Паркинсона и других неврологических болезней таким же образом.
Они планируют заняться расследованиями, позволят ли возраст, окружающая среда и болезненное состояние им затачивать фильтр далее для болезни Паркинсона.