Международная группа исследователей завершила работу по физическому картированию генома одного из переносчиков малярии в Центральной и Южной Америке – малярийного комара Anopheles albimanus. Карта открывает новую страницу в изучении одного из самых опасных переносчиков возбудителей малярии, от которого ежегодно умирают более 400000 человек в мире, и расширяет возможности в борьбе со смертельной инфекцией.
"Самая эффективная профилактика распространения малярии – искоренение переносчиков болезни – малярийных комаров," говорит Глеб Артемов, старший научный сотрудник лаборатории «Экоген». "Для этого мы используем разные средства, от осушения заболоченных территорий до создания трансгенных комаров. Разработка новых подходов требует изучения генетики, физиологии и экологии рода Anopheles, что невозможно без информации о его полной последовательности ДНК."
Два года ученые изучали геном Anopheles albimanus. Они получили изображения его хромосом и провели обширную серию экспериментов. В конце ноября 2016 года они завершили наиболее полную версию геномной сборки комара и представили его физическую карту.
"Это третье отображение генома рода Anopheles," говорит Игорь Шарахов, ведущий научный сотрудник Ecogen и доцент Virginia Tech. "Первая карта наиболее опасного малярийного комара Anopheles gambiae была опубликована в 2002 году, а затем были созданы карты азиатского вида Anopheles stephensi и Anopheles atroparvus, москита, обитающего в Европе и России. Сравнение этих видов выявило новые геномные перестройки, которые изменили порядок генов между разными хромосомами."
Физическая карта генома позволяет определить положение каждого гена в хромосомах и изучить эволюцию малярийных комаров, сравнивая порядок генов у разных видов. Карта может, например, помочь ученым, создающим трансгенных комаров, определить оптимальное место для включения фрагментов ДНК в геном.
Использование карты уже помогло ученым TSU и Virginia Tech обнаружить и исправить предыдущие ошибки в сборке генома Anopheles albimanus. Результаты их исследований легли в основу статьи, опубликованной в январе 2017 года в престижном научном журнале.
Новая карта генома доступна в VectorBase с открытым доступом.