«Кто-то с муковисцедозом имеет об одном меньшем количестве чайной ложки воды в слизистом в их легких, делая его намного более толстым», сказал Кори Нислоу, преподаватель в факультете UBC фармацевтической науки. «Мы хотели знать, как окружающая среда воздушной трассы и бактерии взаимодействуют и развиваются».Исследование включило бактерии под названием Burkholderia cenocepacia.
Эти бактерии обычно живут в почве и окружающей среде, но они могут стать оппортунистическими болезнетворными микроорганизмами в больных муковисцедозом. В 1990-х эпидемия Burkholderia вспыхнула в Канаде и Соединенном Королевстве, приводящем к сотням инфекций в до н.э. одном. Сегодня, бактерии все еще наносит ущерб, поскольку это может быть передано от пациента пациенту и внутри и снаружи больницы. Часто, если пациент борется с инфекцией, они лишены права на получение потенциально спасительной пересадки легкого.
Burkholderia – трудные бактерии, чтобы рассматривать. Это – так называемые грамотрицательные бактерии и содержит тонкое, но очень трудное, чтобы проникнуть через дополнительное мембранное пальто, которое ограждает его от внешней среды, включая большинство антибиотиков.
Для исследования Нислоу использовал образцы Burkholderia, собранного от до н.э. пациентов во время вспышки в 1990-х, чтобы изучить генетику бактерий, а также как они взаимодействуют со своей средой, чем-то известным как фенотип. Они сравнили эти результаты, чтобы узнать, где мог бы быть генетический компонент к особенностям бактерий.
Исследователи нашли что, чем дольше бактерии жили в своем хозяине, тем меньше и меньше токсичных черт они сохранили. Они также нашли, что геном бактерий часто становился меньшим со временем, предполагая, что некоторые напряжения приспосабливались к окружающей среде в легких пациента.
Геномы Берхолдерии очень покорны, и многие напряжения, изолированные от пациентов, оптимизировали свои геномы и жили и выжили с меньшим количеством ДНК. У различных напряжений может быть в три раза больше ДНК, чем другие.«Эта гибкость делает все это более важным, чтобы понять, как бактериальный геном развивается со временем в пациенте, так, чтобы мы могли бы проектировать лучшие лечения различных фаз инфекции», сказал Нислоу.Результаты предоставляют исследователям ряд генов, которые характерны для всех напряжений несмотря на огромную изменчивость в размере генома между бактериями в различных пациентах.
«Мы определили единый набор основных генов, которые характерны для всех терпеливых образцов», сказал он. «Следующий шаг должен определить наркотики, которые характерны для тех генных продуктов».Для этого следующего шага он и его команда сошлются на результаты против библиотеки больше чем 2 000 наркотиков, собранных Nislow, чтобы определить лучшие варианты лечения.
Они также расширяют работу, продолжая собирать образцы из новых случаев Burkholderia в больных муковисцедозом.