«Мы показываем в этом исследовании, что БОДРЫЕ действия как центр для организации связанных с раком генов в ядре клетки», говорит ведущий автор исследования Раньян Перера, доктор философии, научный директор аналитической геномики и биоинформатики в Озере SBP Нона. «Эти гены могут обещать индивидуально или в сочетании с БОДРЫМ как терапевтические цели в борьбе с раком».БОДРЫЙ тип молекулы, называемой, долго не кодируя РНК (lncRNA). LncRNAs долго рассматривались как барахло, потому что они не переведены на белок.
Однако за прошлые несколько лет они были связаны с существенными ролями в клетке, и их misregulation был связан с болезнью.Группа Переры ранее показала, что БОДРЫЙ присутствует в более высоких уровнях в клетках меланомы, чем в нормальных клетках кожи и что понижение уровней молекулы способствует смерти раковой клетки. Они также нашли, что суммы БОДРОГО и другого lncRNAs подняты при раке простаты по сравнению с нормальной тканью, предположив, что БОДРЫЙ мог бы быть диагностический или предвещающий маркер для рака.«В некоторых терпеливых образцах опухоли и линиях раковых клеток, исследователи нашли, что количества определенного lncRNAs увеличены», говорит первый автор исследования Бонгионг Ли, доктор философии, постдокторский партнер в лаборатории Переры. «Но понять значение этого, мы должны знать то, что эти молекулы делают в клетках.
Лучший способ сделать, который должен посмотреть на их обязательных партнеров».LncRNAs связывают со многими компонентами клетки включая ДНК и белок. Лаборатория Переры решила пойти шаг вперед и заняться расследованиями, вступает ли БОДРЫЙ в контакт с другими РНК в клетках меланомы.
Команда использовала технику, что химически перекрестные связи, БОДРЫЕ ее соседям, которые показали, что БОДРЫЙ действительно связал с 115 партнерами по РНК, которые кодируют для белков, шести из них, рассмотрели «крупных» партнеров. Интересно, все шесть генов были уже вовлечены во множество раковых образований.Ученые тогда использовали CRISPR/Cas9, более новый геномный метод модификации, чтобы уменьшить БОДРОЕ выражение в клетках меланомы, находя что уровни большинства ее шести крупных партнеров также уменьшенный в результате.
Перепредставление БОДРОГО нормализовало эти уровни, найденная группа. Кроме того, в модели мыши с ослабленным иммунитетом меланомы, опухоли с только небольшим количеством БОДРЫХ стали намного медленнее, чем сделал опухоли с более типичными уровнями РНК.Группа также интересуется пониманием роли SPRIGHTLY в метастазе. В новом исследовании большом анализе данных отношений среди различной РНК SPRIGHTLY обязательные партнеры, проводимые доктором философии сотрудников SBP Shaojie Zhang, (Университет Центральной Флориды) и Анимеш Рэй, доктор философии, (Институт Выпускника Keck в Клермонте, Калифорния), предполагают, что lncRNA мог быть вовлечен в метастаз меланомы к мозгу.
Команда планирует проверить эту гипотезу и других, предложенных сетевым анализом.