В исследовании Йельского университета использовалось секвенирование ДНК для получения наиболее полной картины молекулярного ландшафта меланомы. (Иллюстрация Михаэля Хельфенбейна)
(Medical Xpress) – Генетики, биохимики и структурные биологи Йельского онкологического центра нарисовали наиболее полную картину молекулярного ландшафта меланомы, очень агрессивного и часто смертельного рака кожи. Исследование опубликовано 29 июля в онлайн-публикации Nature Genetics.
Меланома, вызванная чрезмерным воздействием солнечного ультрафиолетового (УФ) излучения, вызывает подавляющее большинство всех смертей, связанных с раком кожи. В этом году в Соединенных Штатах будет около 76000 новых случаев меланомы и 9000 смертей от этой болезни.
В исследовании Йельского университета использовались мощные технологии секвенирования ДНК для изучения 147 меланом, происходящих как из открытых, так и из защищенных от солнца участков.
Исследование выявило избыток УФ-индуцированных мутаций в меланомах, подвергшихся воздействию солнечных лучей. Большинство из них являются мутациями-пассажирами, которые не играют функциональной роли при меланоме. «Мы разработали математическую модель, чтобы отсортировать соответствующие изменения ДНК из более чем 25 000 полных мутаций», говорит ведущий автор Майкл Краутхаммер, доцент кафедры патологии, который руководил биоинформатикой исследования.
Анализ выявил частое «усиление функции». мутация в гене RAC1, которая имеет все признаки УФ-повреждения. Исследование предоставило доказательства того, что мутантный белок вызывает ускоренный рост и движения среди нормальных пигментных клеток, которые являются клетками меланомы происхождения. ?? Вероятно, это происходит на ранней стадии развития опухоли и способствует росту злокачественных клеток и их распространению на отдаленные участки, ?? сказала автор-корреспондент Рут Халабан, старший научный сотрудник Йельской школы медицины и член Йельского онкологического центра.
Ученые из Йельского университета говорят, что онкогенная мутация RAC1 встречается примерно в 9% меланом на коже, подвергшейся воздействию солнца, и является третьей по частоте мутацией после известных мутаций BRAF и NRAS. Они считают, что распространенность мутации RAC1 требует разработки методов лечения, направленных на этот конкретный путь.
Команда также определила мутации, которые выводят из строя белки ?? известны как опухолевые супрессоры ?? которые подавляют злокачественные новообразования. Примечательно, что мутировавший белок, известный как PPP6C, встречается только в опухолях, уже мутировавших в генах BRAF и NRAS. «Наше исследование наметило новый, совместный путь развития рака», Халабан объяснил.
Наконец, исследование раскрывает новые взгляды на более редкие меланомы из частей тела, защищенных от солнца. Вместо мутаций эти меланомы имели дубликаты известных онкогенов.