Ученые из Нью-Йорка говорят, что они разработали алгоритм, который увеличивает способность обнаруживать гены рака.
Исследователи из Института математических наук Куранта при Нью-Йоркском университете говорят, что они применили свой алгоритм для картирования набора генов-супрессоров опухолей, участвующих в развитии рака легких.
Алгоритм использует данные из генных чипов Affymetrix, которые могут сканировать геномы сотен пациентов, чтобы найти прирост и убыток в копиях генов.
Предыдущие исследования показали, что определенные генные чипы – технология, которая позволяет проводить скрининг в масштабе всего генома на наличие мутаций в генах или изменений в экспрессии генов сразу, – пролили свет на гены и механизмы, участвующие в возникновении и распространении рака.
В частности, хромосомные сегменты, при удалении в одной или обеих копиях геномов группы онкологических больных, указывают на местоположения генов-супрессоров опухолей, вовлеченных в рак. В исследовании NYU основное внимание уделялось автоматическим методам надежного обнаружения таких генов, их местоположения и границ.
Результаты будут опубликованы в июльском номере American Journal of Human Genetics.
© United Press International, 2006 г