Ценность пересечения секвенирования экзомов индивидов (всех экспрессируемых генов) или полных геномов для поиска редких генетических вариантов – в крупном масштабе – с их подробной информацией из электронных медицинских карт (EHR) имеет большое значение "бесчисленные преимущества, включая изучение основ биологии человека, раннюю идентификацию предотвратимых и излечимых заболеваний, а также идентификацию и подтверждение новых терапевтических целей," написал Дэниел Дж. Рейдер, доктор медицинских наук, заведующий кафедрой генетики в Медицинской школе Перельмана при Пенсильванском университете, на этой неделе в науке вместе со Скоттом М. Дамрауэр, доктор медицины, доцент кафедры хирургии в Пенсильвании и Медицинском центре по делам ветеранов в Филадельфии.
Их комментарий сопровождает два связанных исследования по теме в одном и том же номере. Один сообщает о секвенировании всего экзома более 50 000 человек из системы здравоохранения Гейзингер в Пенсильвании и об анализе редких вариантов с данными из продольных электронных медицинских карт. Они идентифицировали сотни людей с редкими "Потеря функции" варианты генов, которые были связаны с наблюдаемыми физиологическими характеристиками или фенотипами. Во второй статье сообщается об исследовании, которое выявило в той же базе данных лиц с семейной гиперхолестеринемией, многие из которых не были диагностированы или лечились.
"Эти результаты демонстрируют огромный потенциал этого подхода для продвижения научных биомедицинских открытий и оказания влияния на практику клинической медицины," авторы написали.
Поскольку секвенирование постоянно увеличивающихся наборов данных экзомов человека – и полных геномов – стало быстрее, точнее и дешевле, исследователи могут быстрее находить редкие генетические варианты. А затем сопоставление этих редких генетических находок с данными фенотипа EHR может дать важную информацию для здравоохранения.
"Многие моногенные расстройства, такие как семейная гиперхолестеринемия [СГ], не диагностируются," Рейдер сказал. "После того, как человек с моногенным заболеванием будет идентифицирован, он не только может быть назначен на соответствующее медицинское вмешательство, но мы также можем проверить членов его или ее расширенной семьи, чтобы увидеть, кто еще несет мутантный ген и может извлечь выгоду из профилактических подходов." Он цитирует недавний список из 59 "с медицинской точки зрения действенный" гены, курируемые Американским колледжем медицинской генетики и геномики (ACMG), в которых мутации с потерей функции могут привести к конкретным медицинским вмешательствам. Например, люди из расширенной семьи человека, у которого обнаружена СГ, который также несет мутацию, должны пройти проверку холестерина и назначить лекарства для снижения холестерина.
"Выявление редких вариантов также может способствовать нашему пониманию более общих и сложных заболеваний, таких как диабет 2 типа или хроническое заболевание почек," Рейдер сказал. "Эти усилия однажды откроют фундаментальную ценность того, что содержит геном для здоровья и болезней, и проложат путь к точной медицине в каждой клинике и больнице."