Поскольку пандемия COVID-19 все еще бушует во всем мире, члены Американского общества генетиков человека (ASHG) работают над тем, чтобы понять, как вирус распространяется и заражает людей, почему существует такая большая вариабельность по восприимчивости и серьезности и где искать потенциальные возможности. терапия. Исследователи представили результаты нескольких исследований, относящихся к текущей пандемии, на Виртуальной встрече ASHG 2020.
Симптомы COVID-19 широко варьируются: от бессимптомных у одних пациентов до смертельных у других. Выяснение роли генетической изменчивости человека может привести к лучшему пониманию восприимчивости к инфекции, а также различий в клинических проявлениях пациентов и исходах.
Три исследования были посвящены генетике человека, восприимчивости и серьезности COVID-19. В первом Джек Космицки, Центр генетики Regeneron, и его коллеги представили результаты крупнейшего на сегодняшний день исследования секвенирования экзома транс-предков COVID-19. Повторяя предыдущие результаты, исследователи определили 3p21.31 локус и предположил, что он способствует изменчивости степени тяжести. Группе не удалось воспроизвести ассоциацию между COVID-19 и локусом ABO, что позволяет предположить, что предыдущий результат мог быть ложноположительным. Помимо ранее сообщенных ассоциаций, Космицки и его коллеги также идентифицировали три новых локуса и три гена, связанных с COVID-19.
Во втором случае Андреа Ганна из Института молекулярной медицины Финляндии и его коллеги сообщили о метаанализе инициативы по генетике хозяев COVID-19, совместной международной деятельности по объединению сообщества генетиков человека для создания, обмена и анализа связанных данных. к COVID-19. Они определили генетический вариант на хромосоме 3, который сильно ассоциировался с тяжестью заболевания, но не с восприимчивостью. Как и все результаты Инициативы, они сразу же доступны на ее веб-сайте без каких-либо ограничений использования.
Третье исследование, представленное Гитой Патак из Йельского университета, предполагает участие нескольких биологических механизмов в госпитализации, вызванной COVID-19. В дополнение к идентификации шести генов, связанных с COVID-19 в двух хромосомных областях, исследователи обнаружили ассоциации с лабораторными показателями, такими как уровни холестерина и кортизола ЛПНП и количество моноцитов, которые согласуются с маркерами воспаления. Вместе эти исследования указывают на интересные области для будущих исследований. Например, все три группы определили хромосому 3 как локус восприимчивости, но требуется дальнейшая работа, чтобы разработать механизм.
В другом исследовании, посвященном COVID-19, А. Rouf Banday, Национальный институт рака, Национальные институты здравоохранения, сообщил об открытии нового варианта фермента ACE2, который вирус SARS-CoV-2 использует для проникновения в клетки-мишени. Исследователи показали, что этот вариант, называемый dACE2, но не ACE2, индуцируется интерферонами и вирусными инфекциями, включая SARS-CoV-2. Полученные результаты важно учитывать для будущих терапевтических стратегий и понимания восприимчивости и исходов COVID-19.
Брендан О’Коннелл, Oregon Health & Научный университет и его коллеги продемонстрировали, что быстрое секвенирование вирусных геномов может позволить идентифицировать конкретные цепи передачи внутри сообщества путем отслеживания мутаций, возникающих с течением времени. Исследователи определили количество занесений и распространение COVID-19 в Орегоне в течение первых шести месяцев после вспышки. В целом, данные убедительно подтверждают, что основным источником появления новых вирусов в Орегоне являются поездки внутри страны.
Наконец, Томико Оскотски из Калифорнийского университета в Сан-Франциско обсудил применение вычислительного конвейера репозиции лекарств для выявления существующих лекарств, которые могут иметь новое терапевтическое применение при COVID-19. На данный момент результаты обнадеживают: эксперименты по валидации показывают, что девять из 12 проверенных на сегодняшний день хитов обладают измеримой противовирусной активностью против SARS-CoV-2.