Материал, не связанный с обычными процессами секвенирования генетического материала в раковых опухолях, может на самом деле нести важную информацию о том, почему только некоторые люди реагируют на иммунотерапию, возможно, предлагая лучшее понимание, чем тип материала, который секвенируется, согласно исследованию, опубликованному исследователями Mount Sinai. 3 апреля в Cell Reports.
Секвенирование генетического материала в раковых опухолях, называемого матричной РНК, изменило индивидуализированную терапию рака и позволило выявить биомаркеры для раннего обнаружения. Достижения в этой области изменили представление ученых о различиях между здоровыми тканями и опухолями.
На сегодняшний день экспрессия генов в опухолях обычно определяется путем захвата матричных РНК; однако они представляют собой лишь часть обнаруженных молекул. Другой тип РНК, называемый некодирующей РНК, долгое время игнорировался как "хлам" и не участвуют в процессах секвенирования. Однако недавние достижения в области генетики показали, что многие некодирующие РНК могут нести важные функции для клеточной биологии, а класс РНК, известный как повторяющиеся элементы, может взаимодействовать с иммунной системой таким образом, который может иметь важное значение для развития нового и персонализированного рака. иммунотерапия.
В своем исследовании исследователи использовали процесс, называемый общим секвенированием РНК, чтобы идентифицировать многие некодирующие РНК, которые обычно остаются незамеченными с помощью более распространенного метода секвенирования. Они показали, что некоторые из этих РНК были специфически экспрессированы в опухолях, которые реагировали на иммунотерапию блокадой контрольных точек у пациентов с раком мочевого пузыря, в то время как другие были связаны с опухолями, которые не были обнаружены иммунной системой.
"Наши выводы говорят о том, что некодирующая РНК в опухолях, особенно повторяющихся элементах, не определяется количественно," сказал старший автор исследования Бенджамин Гринбаум, доктор философии, доцент кафедры онкологии, патологии и медицины (гематология и медицинская онкология) в Институте рака Тиш при Медицинской школе Икан на горе Синай. "Мы считаем, что важные выводы станут результатом анализа всей широты взаимодействия некодирующей РНК опухоли с иммунной системой."
Одно конкретное открытие этого исследования заключалось в том, что один повторяющийся элемент в некодирующей РНК является лучшим предиктором иммунотерапевтического ответа на ингибиторы PDL1, тип лекарственного средства для иммунотерапии рака, чем обычные иммунные сигнатуры у некоторых пациентов. Исследователи Mount Sinai в сотрудничестве с лабораторией Ting в онкологическом центре Массачусетской больницы общего профиля обнаружили, что эти повторяющиеся РНК, по-видимому, изменяют иммунный ответ при раке толстой кишки и поджелудочной железы. Это имеет значение для будущих исследований того, как некодирующие РНК могут быть новыми мишенями для лечения рака и как они влияют на реакцию пациентов на лечение рака.