Геном вируса Эбола дает представления о повторной болезни ‘вспышки’ в Западной Африке

Как описано в газете, геномный анализ и эпидемиологическое расследование указывают, что вспышка в июне 2015 была возрождением либерийской цепи передачи, происходящей из постоянно заражаемого источника. Это также имело место с либерийской вспышкой в марте 2015. Никакое событие не было вызвано реинтродукцией вируса от водохранилища животных или из соседней страны с активной передачей от человека к человеку, по данным исследовательской группы. В то время как мартовская вспышка была прослежена до сексуального контакта, никакая безусловная связь не была найдена для июньского события.

«Когда июньская группа случаев была сначала обнаружена, начальное ожидание следователей состояло в том, что она, вероятно, произошла из реинтродукции вируса из Сьерра-Леоне или Гвинеи, где передача от человека к человеку была активна», объяснило исследование co-first автор Джейсон Т. Лэднер, доктор философии, армии США Медицинский Научно-исследовательский институт Инфекционных заболеваний (USAMRIID). «Это объяснение было одобрено, потому что типичный маршрут передачи вируса Эбола через заразные биологические жидкости от людей в острой фазе болезни, когда они являются самыми симптоматическими».Однако геномное упорядочивание, объединенное с эпидемиологическим расследованием, указало, что случаи не представляли реинтродукцию из соседней страны, но вместо этого были результатом вирусной передачи из «постоянно заражаемого» источника в Либерии – значение, например, выживший после болезни, который продолжал нести вирус в течение нескольких месяцев.

«Хотя это открытие не обязательно играло главную роль в контроле этой конкретной группы, это, конечно, подчеркнуло риск для дополнительных вспышек, даже в областях, где активное распространение вируса было остановлено», заявил Ладнер. «Это понимание привело к усиленной бдительности, которая допускала быстрый ответ на дополнительные вспышки, которые произошли».Вирус Эбола вызывает тяжелую геморрагическую лихорадку в людях и нечеловеческих приматах с высокими показателями смертности и продолжает появляться в новых географических точках, включая Западную Африку, место самой большой зарегистрированной вспышки до настоящего времени. О больше чем 28 000 подтвержденных, вероятных и подозреваемых случаев сообщили в Гвинее, Либерии и Сьерра-Леоне, больше чем с 11 000 смертельных случаев, о которых сообщают, по данным Всемирной организации здравоохранения.

В газете, исследовательской группе – который включает ученых из американских Центров по контролю и профилактике заболеваний, либерийского Министерства здравоохранения, и USAMRIID – указывает на риск вспышек геморрагической лихорадки Эбола даже после того, как вспышка, как объявляют, закончена. Начиная со вспышки в июне 2015 по крайней мере четыре более зарегистрированных вспышки произошли (2 в Либерии, 1 в Сьерра-Леоне и 1 в Гвинее), по словам авторов.«С эпидемиологической точки зрения это исследование продемонстрировало ценность полного генома, упорядочивающего во время вспышки», сказал co-ведущий-автор Густаво Паласиос, доктор философии, USAMRIID. «Вирусные геномы от июньской вспышки сравнились с тем, что уже было упорядочено, который позволил нам решать, что вирус был действительно либерийским в происхождении. Это помогло подтвердить то, что эпидемиологические команды находили в их расследовании и сосредоточили усилия на поиске потенциальных источников непроходящей инфекции в и вокруг затронутого сообщества».

Согласно Паласьосу, исследование было сделано возможным лабораторной способностью в стране, установленной USAMRIID в 2015 в сотрудничестве с либерийским Институтом Биомедицинского Исследования (LIBR) и либерийским Министерством здравоохранения. Это современное состояние, средство для упорядочивающего высокой пропускной способности позволяет команде проводить около геномного упорядочивания в реальном времени.Вирусные геномы также помогли рассказать другую историю, сказал USAMRIID co-first автора Майкла Р. Вайли, доктора философии, он отметил, что льготный тариф эволюции был связан со вспышкой в июне 2015 – подразумевать, что генетическая подпись вируса не изменялась значительно со временем.

Когда команда посмотрела на группу в марте 2015, которая была связана с сексуальной передачей, они нашли ту же самую подпись – льготный тариф эволюции.Та «подпись» могла быть полезным инструментом для оценки источника будущих вспышек, по словам Вайли. Определенно, это указывает, что вирус, вероятно, копирует по более низкому уровню во время непроходящих инфекций, по сравнению с острой фазой болезни.«Не ясно, что процессы стимулируют этим сокращением темпа повторения, или какую роль это изменение в уровне может играть в установлении или поддержании непроходящих инфекций», сказал Вайли. «Важно, поэтому, лучше понять природу этих непроходящих инфекций, чтобы предотвратить продолжение вспышки, как только передачей от человека к человеку через острых людей управляют.

Кроме того, есть потребность разработать методы лечения, которые являются эффективными при лечении этих непроходящих инфекций, которые могут способствовать долгосрочным хроническим проблемам со здоровьем, связанным с некоторыми выжившими после геморрагической лихорадки Эбола».Паласьос заявил, что команда продолжает исследовать дополнительные вспышки вируса Эбола, которые произошли в Либерии, включая группу случаев в ноябре 2015 и недавнюю группу случаев, которые произошли ранее в этом месяце.

Они также далее исследуют темп вирусной эволюции во время непроходящих инфекций, упорядочивая геномы вируса Эбола от спермы выживших после болезни.

Блог Брикса