Новый свет проливает свет на роль генетической регуляции в предрасположенности к распространенным заболеваниям

Международная группа исследователей из Королевского колледжа, Оксфордского университета, института Wellcome Trust Sanger и медицинского факультета Женевского университета обнаружила несколько тысяч новых генетических вариантов, влияющих на экспрессию генов, некоторые из которых ответственны за предрасположенность к распространенным заболеваниям, приближая их к биологическая интерпретация личных геномов.

Различия в риске генетических заболеваний между одним человеком и другим основаны на сложной этиологии. В самом деле, они могут отражать различия в самих генах или же различия, лежащие в основе регионов, участвующих в регуляции этих же генов.

Под регуляцией гена мы подразумеваем решение, которое клетка принимает относительно того, когда, где и на каком уровне активировать или подавить экспрессию гена. Теоретически, два человека могут, таким образом, иметь общий ген, который совершенно идентичен, но при этом демонстрирует различия в своей предрасположенности к заболеванию из-за генетических различий, касающихся регуляции (сверхэкспрессии или недоэкспрессии) этого же гена.

Многочисленные команды в настоящее время пытаются составить карту регионов, участвующих в регуляции генов. Задача непростая, но бесценная, поскольку позволяет понять все генетические причины, которые могут объяснить предрасположенность к определенным заболеваниям.

Работа с близнецами

Эммануил Дермитзакис, профессор медицинского факультета Луи-Жанте и член NCCR Frontiers in Genetics и Женевского института генетики и геномики (IGE3), является специалистом в области так называемой генетики сложных признаков. С международной командой во главе с профессором Тимом Спектором (Королевский колледж), профессором Марком Маккарти (Оксфордский университет) и доктором. Панос Делукас (Wellcome Trust Sanger Institute), он публикует исследование, в котором выделяются тысячи этих генетических вариантов, которые, кажется, объясняют индивидуальные различия в экспрессии генов.

Для этой работы исследователи использовали образцы трех разных типов тканей (жировая ткань, кожа и клетки крови), собранные у более чем 800 гомозиготных (идентичных) и дизиготных близнецов.

"Идентификация вариантов, которые контролируют активность многих генов, является более сложной задачей, чем мы ожидали, но мы разрабатываем соответствующие инструменты, чтобы выявить их и понять их вклад в заболевание," комментарии Панос Делукас. "Современная генетика человека в сочетании с образцами, предоставленными участниками таких исследований, как TwinsUK, делает большие шаги в поиске генетических виновников болезней человека."

Метод, которым следовали исследователи, позволил им выявить около 358 вариантов, которые, по-видимому, связаны с предрасположенностью к определенным заболеваниям, включая количественную оценку вклада редких регуляторных вариантов, которые ранее было невозможно идентифицировать обычными методами анализа.

"Наша работа дополняет тех, кто ранее продемонстрировал вклад общих вариантов в предрасположенность к этим расстройствам", объясняет Эммануил Дермитзакис. "Благодаря этому новому уровню знаний, и если нам удастся адаптировать эту методологию для поиска этих вариантов у каждого человека, это станет мощным инструментом, помогающим прогнозировать предрасположенность к определенным заболеваниям и, что более важно, понимать биологическую этиологию для развития и применять индивидуальные методы лечения."

Блог Брикса