Комбинированное секвенирование цельной экзомной опухоли и секвенирование крови у педиатрических онкологических пациентов выявило мутации, которые могут помочь объяснить причину рака или потенциально повлиять на клиническую помощь при онкологических заболеваниях у 40 процентов пациентов в исследовании, проведенном исследователями из Медицинского колледжа Бейлора и Техасского детского рака. Центр.
Секвенирование показало неожиданные результаты у ряда пациентов, включая мутации в генах, ранее не связанных с конкретным типом рака, который был диагностирован, что указывает на полезность широкомасштабного тестирования как опухолей, так и образцов крови для детей с диагнозом солидные опухоли. , говорят старшие соавторы исследования д-р. Шэрон Плон, профессор педиатрии в Baylor, и доктор. Уилл Парсонс, доцент педиатрии Детского онкологического центра Бейлора и Техаса.
Исследование, которое публикуется в текущем выпуске журнала JAMA Oncology, является частью текущего проекта Baylor College of Medicine Advancing Sequencing in Children’s Cancer Care (BASIC3), финансируемого за счет 6 долларов США.Грант в размере 6 миллионов от Национального института исследования генома человека и Национального института рака.
Более чем у 25 процентов пациентов, участвовавших в исследовании, в опухоли была обнаружена генетическая мутация, потенциально имеющая клиническое значение, в том числе некоторые, которые могут определять выбор лечения в случае рецидива опухоли. Ангшумой Рой, доцент кафедры патологии & иммунологии в Детской больнице Бейлора и Техаса и одним из участников исследования. Почти у 10 процентов были мутации зародышевой линии в генах предрасположенности к раку у взрослых и детей, которые объясняли причину их рака, а у дополнительных пациентов были мутации в генах, которые были связаны с риском других заболеваний, кроме рака.
"Наши результаты были намного шире, чем мы ожидали, как в опухоли, так и в крови," сказал Плон, который также является профессором молекулярной генетики и генетики человека в Бейлоре и директором клинических и исследовательских программ генетики рака в Детской больнице Техаса. "В значительном количестве случаев результаты выявили мутации в генах, о которых мы даже не подумали бы о тестировании, потому что не было известно, что они связаны с детским раком. Эти результаты предполагают, что использование целенаправленного генетического тестирования может упустить важные результаты."
В исследовании сообщалось о результатах первых 150 пациентов с недавно диагностированной солидной опухолью, включенных в исследование BASIC3 в Детском онкологическом центре Техаса. Близится к завершению проект BASIC3, набирающий 280 пациентов из центра.
"Важным аспектом этого исследования является то, что оно сосредоточено как на том, что опухоль может сказать нам с точки зрения потенциальных молекулярных мишеней для лечения, так и на том, что образцы крови показывают о риске наследственного рака и других генетических заболеваний для пациента и его семьи," сказал Парсонс.
"Это важное исследование и убедительная иллюстрация того, как квалифицированные врачи могут эффективно использовать геномные данные в клиническом контексте," сказал доктор. Ричард Гиббс, профессор молекулярной генетики и генетики человека и директор Центра секвенирования генома человека в Бейлоре. Гиббс и доктор. Кристин Энг, профессор молекулярной генетики и генетики человека в Бейлоре, возглавляет исследования по проведению геномного тестирования, проводимого в Лаборатории полного генома в Бейлоре, и оценки результатов.
В том же выпуске журнала JAMA Oncology группа исследователей из Дана-Фарбер / Бостонского детского онкологического центра и заболеваний крови сообщила об аналогичных успешных попытках разработать рекомендации по лечению на основе генома для пациентов с детскими солидными опухолями.
Общая цель проекта BASIC3 состоит в том, чтобы интегрировать информацию о секвенировании всего экзома крови и опухоли, полученную во время постановки диагноза, в клиническую помощь онкологическим больным детского возраста с солидными опухолями и опухолями головного мозга.
Помимо разработки протоколов для выполнения клинического геномного тестирования и оценки результатов этого тестирования для пациентов, включенных в исследование, проект также изучает этические и социальные вопросы, связанные с геномным тестированием, включая предпочтения как семей, так и онкологов в отношении отчетности. этих сложных результатов и методов для улучшения коммуникации между семьями и онкологами. Эти усилия возглавляются доктором. Лоуренс Маккалоу и Ричард-стрит из Бейлора. Первые результаты этой части исследования недавно были опубликованы в журнале Pediatrics.
Проект BASIC3 и связанные с ним исследования способствовали разработке проспективных клинических испытаний с использованием "прецизионная онкология" или "персонализированная медицина" подходы для детских онкологических больных, в том числе педиатрическое исследование MATCH Национального института рака, в котором будет использоваться секвенирование ДНК и РНК образцов опухоли и крови для выбора методов молекулярно-направленной терапии для детей с рецидивирующим и рефрактерным раком. Испытание будет проводиться через консорциум группы детской онкологии (COG), финансируемой NCI, и под руководством исследователей COG и NCI, включая докторов. Парсонс, Плон и Стейси Берг, профессор педиатрии в Детском онкологическом центре Бейлора и Техаса.